Sequence markers kunt u inzetten om specifieke posities op de tijd lijn te markeren. U plaatst een marker door op de V-toets te drukken. Boven de tijdlijn verschijnt dan een oranje driehoekje. De geplaatste markers worden getoond in het Sequence Marker menu. Daar kunt u een commentaar geven bij de individuele markers. Deze commentaren kunt u zichtbaar maken in de monitor, door onder het View-menu op Overlay/Marker te klikken. Door op een marker te dubbelklikken springt u automatisch naar die marker. De sequence markers kunnen tevens worden ingezet als hoofdstukken voor een dvd of Blu-ray disk.